تأسست كلية الاقتصاد والعلوم الإدارية ( التجارة سابقاً) بموجب قرار مجلس الجامعة سنة 1993 وبدأت بقسمين هما قسم المحاسبة وقسم إدارة الأعمال، واعتباراً من العام الجامعي 1996/1997 وتلبية لاحتياجات المجتمع الفلسطيني التنموية تم إضافة ثلاثة أقسام جديدة : قسم الاقتصاد, قسم العلوم السياسية, وقسم الإحصاء التطبيقي، كما تقوم الكلية بتطوير خططها الدراسية وتطوير أقسامها وإضافة برامج وتخصصات جديدة التي يحتاجها المجتمع الفلسطيني؛ فقد قامت الكلية بإضافة قسمي إدارة الأعمال - شعبة اللغة الإنجليزية في العام الجامعي 2005/2006 , وقسم المحاسبة - شعبة اللغة الإنجليزية في العام الجامعي 2006/2007, ومواكبة للتغيرات والمتطلبات الفلسطينية المستجدة تم طرح برنامج لمنح درجة الماجستير في تخصصات (المحاسبة, إدارة الأعمال, العلوم السياسية, والإحصاء), وفي العام الجامعي 2007/2008 تم طرح برنامجاً لمنح درجة الماجستير في تخصص الاقتصاد.