في إطار اتفاقية التعاون المشترك بين كلية الزراعة – جامعة القاهرة بجمهورية مصر العربية وكلية الزراعة والبيئة – جامعة الأزهر– بغزة، تم الاتفاق على البرنامج التنفيذي لفتح برنامج (الماجستير) في كلية الزراعة والبيئة – جامعة الأزهر بغزة وذلك ضمن بنود تم الاتفاق عليها وتم توثيقها من إدارة الجامعتين.

تمنح جامعة الأزهر بغزة بالتعاون مع جامعة القاهرة درجة الماجستير في الزراعة في ثلاثة تخصصات هي:
1- الإنتاج النباتي والوقاية.
2- الصناعات الغذائية.
3- الإنتاج الحيواني والدواجن.

شروط الالتحاق في برنامج الماجستير:

1. أن يكون الطالب حاصلاً على درجة البكالوريوس في الزراعة من جامعة الأزهر بغزة أو ما يعادلها من أي جامعة أخرى معترف بها.
2. ألا يقل التقدير في درجة البكالوريوس عن جيد.
3. أن يجتاز امتحان القبول و المقابلة الشخصية أمام لجنة المقابلات حسب النظام.

متطلبات نيل درجة الماجستير:
يمنح الطالب درجة الماجستير في الزراعة والبيئة بعد أن يتم دراسة المتطلبات التالية:

1. دراسة المساقات الاستدراكية أو التكميلية التي يحددها القسم.
2. دراسة 30 ساعة معتمدة (21 ساعة معتمدة إجبارية و9 ساعات معتمدة اختيارية).
3. يخصص للرسالة 6 ساعات معتمدة وتتضمن إعداد الرسالة والنجاح في امتحان المناقشة.
4. يقوم الطالب بدراسة اللغة الإنجليزية ومقدمة في علم الحاسوب كمقررات نجاح.