الرؤية
· الريادة والتميز في مجال بحوث المياه والبيئة على المستوى المحلي والإقليمي والدولي
· الريادة في بحوث المياه والبيئة على المستويين المحلي والإقليمي, وذلك عبر تركيز جميع الجهود على حل مشاكل المياه والبيئة من خلال البحث والتدريب والتعليم والتوعية وخدمة المجتمع والتعاون الدولي.
· مصدر أولى ورئيسي للمعلومات العلمية، وصوت يعتمد عليه في مجال التخطيط المستقبلي في مجال المياه والبيئة.
· تدريب وتطوير القيادات الجديدة الواعدة في قطاعات المياه والبيئة.
· نموذج ناجح ومتميز لمعاهد المياه والبيئة في المجال الأكاديمي والبحثي في الجامعات المحلية و العربية.
الرسالة
· تقديم المبادرات العلمية الناجحة لحل مشاكل المياه والبيئة في جميع المستويات المحلية والإقليمية والدولية عبر البحوث الإبداعية والتدريب المستمر و الاستشارات ونشر المعرفة
· العمل ليكون للمعهد دورا قياديا ناجحا في تطوير وإعداد وتنفيذ الخطط الأكاديمية والبحثية في مجال المياه والبيئة.
· إنتاج أوراق وبحوث علمية محكمة تعالج المواضيع الأساسية في مجال المياه والبيئة.
· إشراك الباحثين من مختلف التخصصات العلمية في العمل الجماعي المشترك لإيجاد حلول للمشاكل المتعلقة بالمياه و البيئة.